كتابخانه تخصصي مسجد گوهرشاد، وابسته به كتابخانه آستان قدس رضوي، با هدف نگهداري از نسخه‌هاي خطي و چاپي سال 1332 خورشيدي، حدود 18 سال پس از وقوع يكي از گسترده‌ترین مقاومت‌ها علیه اقدامات ضدمذهبی پهلوي اول در اين مسجد، به همت مرحوم سيدسعيد طباطبايي  از نیکوکاران و شیفتگان کتاب و کتابخانه تأسيس شد.   این کتابخانه در بدو تاسیس  5000 جلد كتاب چاپي و خطي داشت  که با عنايت به سنت حسنه وقف، روز به روز بر رونق اين كتابخانه افزوده شد و مورد استقبال و توجه خاص مدرسان و طلاب حوزه علميه قرار گرفت و در سال 1345 كتابخانه جامع گوهرشاد به اداره اوقاف واگذار شد. 
در سال 1368 به دليل كمبود فضا و نياز به مكاني وسيع‌تر با تلاش آستان قدس رضوي، ساختمان فعلي كتابخانه با مساحت 1200 مترمربع زيربنا احداث و در سال 1369 اداره مسجد و كتابخانه جامع گوهرشاد پيرو موافقت مقام معظم رهبري به آستان قدس محول شد و از آن پس رشد فزاينده‌اي را طي كرد.
در حال حاضر در این کتابخانه بالغ بر ۰۰۰/۶۵ کتاب چاپی فارسی و عربی و لاتین و ۳۸۸۲ نسخه خطی موجود  می باشد. برای کسب اطلاعات بیشتر وب سایت سازمان کتابخانه ها، موزه ها و مركز اسناد آستان قدس رضوي را كليك نمائيد.