نرم افزار هاي ذکر شده در نوشته قبلي بجز موارد ي که گفته شد، در نوشته هاي پژوهشي براي ارجاعات درون و برون متني  کاربرد دارد. براي ارجاع به منابع مورد استفاده پژوهش خواه از محيط وب و يا پايگاههاي اطلاعاتي همانند Ebsco, ScienceDirect, SAGE,Emerald و يا اتصال به منابع  و پايگاه هاي اطلاعاتي کتابخانه ها همانند کتابخانه کنگره، بي ال و ... .تواناست. در اين گونه موارد نيازي به کپي و پيست نيست بلکه بر اساس موارد انتخابي مي توان آنها را به منابع و مآخذ خود اضافه کرد. ايحاد کتابشناسي هاي مورد نياز و تخصصي را نيز بايد به قابليت هاي اين نرم افزارها اضافه کرد.

البته بايد به خاطر داشت استفاده از اين نرم افزارها نياز به اشتراک و يا استفاده از قفل شکسته آن د ر ايران است. تا حدودي براي رفع اين معضل مي توان از نرم افزارهاي مشابه رايگان که چنين کارآيي را دارد استفاده نمود. دو نرم افزار  مقبول رايگان براي اين منظور : Zotero‌ که با مرورگر فايرفاکس هم خواني و انطباق دارد ( نسخه دوم آن نصب شود) و ديگري Mendeley‌ است.  Mendeley‌ با نرم افزار Zotero  ارتباط داشته و امکان فراخواني فايل ها از آن را به کاربر مي دهد. ضمنا نرم افزار Mendeley نسخه رو ميزي بدون نياز به اينترنت هم دارد.